上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院成立于1960年。經(jīng)過50余年的建設(shè)，現(xiàn)已發(fā)展成為一個學(xué)科較齊全、設(shè)備先進(jìn)、學(xué)術(shù)水平較高、成果轉(zhuǎn)化能力較強(qiáng)、為上海和全國農(nóng)業(yè)發(fā)展提供強(qiáng)有力支撐的地方綜合性農(nóng)業(yè)科研機(jī)構(gòu)。
目前，全院下設(shè)作物育種栽培研究所、林木果樹研究所、設(shè)施園藝研究所、食用菌研究所、畜牧獸醫(yī)研究所、生態(tài)環(huán)境保護(hù)研究所、農(nóng)業(yè)科技信息研究所（數(shù)字農(nóng)業(yè)工程與技術(shù)研究中心）、生物技術(shù)研究所、農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)與檢測技術(shù)研究所、上海市農(nóng)業(yè)生物基因中心等10個研究機(jī)構(gòu)， 1個綜合服務(wù)中心和1個綜合試驗(yàn)站。擁有17個和部級科技創(chuàng)新平臺和成果轉(zhuǎn)化平臺，8個市級科技平臺。館藏各類中外書刊30余萬冊。
全院現(xiàn)有在職職工908名，其中專業(yè)技術(shù)人員555名，國家及地方領(lǐng)軍人才16名，高級專業(yè)技術(shù)職務(wù)科技人員221名（研究員95名），碩、博士386名（博士133名），享受特殊津貼專家71名，擁有博士后科研工作站1個；形成了糧油作物種質(zhì)創(chuàng)新與推廣應(yīng)用、園藝作物新品種選育與高效栽培、食用菌種質(zhì)創(chuàng)制與產(chǎn)業(yè)化技術(shù)、畜禽新品種選育與健康養(yǎng)殖、生態(tài)農(nóng)業(yè)與植物病蟲害綠色防控、農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量與保鮮加工技術(shù)、農(nóng)業(yè)生物技術(shù)與資源評價利用、現(xiàn)代農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)與數(shù)字農(nóng)業(yè)技術(shù)等八大優(yōu)勢學(xué)科（領(lǐng)域）；與30多個國家或地區(qū)開展科技交流和合作研究；編輯出版《上海農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)》、《食用菌學(xué)報(bào)》和《食用菌》等7種學(xué)術(shù)類、技術(shù)類刊物；重點(diǎn)培育種子種苗、食（藥）用菌、生物疫苗三大科技產(chǎn)業(yè)；科技服務(wù)立足上海、輻射長三角，服務(wù)全國，在上海和全國各地建有新品種和技術(shù)示范基地170余個。50多年來，取得各類科技成果1340余項(xiàng)，獲部、市級以上科技獎勵成果349項(xiàng)，其中，科技獎勵23項(xiàng)，部、市級科技進(jìn)步一等獎28項(xiàng)；獲得專利和植物新品種權(quán)、通過審（認(rèn)）定品種670余件，其中通過國家審（認(rèn)）定品種45件；發(fā)表論文4770篇，出版專著和編著220余部；自2003年起連續(xù)九年獲上海市文明單位榮譽(yù)稱號，2011年獲全國文明單位榮譽(yù)稱號。
面對新形勢，市農(nóng)科院將始終把科技創(chuàng)新作為立院之本，把加速農(nóng)業(yè)科技進(jìn)步、提升農(nóng)業(yè)科技化水平作為根本任務(wù)，把促進(jìn)農(nóng)業(yè)穩(wěn)定發(fā)展和農(nóng)民持續(xù)增收作為根本宗旨，通過大力實(shí)施農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新工程、推廣應(yīng)用科技成果、積極開展科技合作共建、開展農(nóng)民培訓(xùn)等有力措施，為推動上海城鄉(xiāng)一體化發(fā)展，為上海率先實(shí)現(xiàn)農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化，為大力推進(jìn)上海農(nóng)業(yè)生態(tài)文明建設(shè)做出新的貢獻(xiàn)。